Стресс приводит к развитию множества болезней крокодилов. Под стрессом здесь подразумевается любое событие, нарушающее равновесие в организме, которое в большинстве случаев вызывает выброс в кровь гормонов надпочечников. В этот процесс вовлечены вегетативная нервная система, ось гипоталамус-надпочечники, нейропептиды, нейротрансмиттеры и нейромедиаторы. Ветеринарные врачи до сих пор не пришли к единому мнению, как измерить стресс.
В исследованиях стресса у крокодилов изучались состояния, вызванные фиксацией, внедрением пролонгированных кортикостероидных имплантов, холодовой шок и перенаселенность. Было установлено, что стресс играет важную роль в физиологических механизмах крокодилов и могут приводить к появлению болезни. Таким образом, предрасполагающими факторами болезней крокодилов можно считать скученность, фиксацию, чрезмерный шум, смена рациона, нестабильность температур и прочие стресс-факторы.