Большинство видов грибов и водорослей. Вовлеченных в инфекционные процессы у рептилий, являются оппортунистическими патогенами, поражающими раненых или иммунодефицитных животных. Важным исключением является Batrachochytrium dendrobatidis (возбудитель хитридиомикоза), который способен вызывать болезнь у клинически здоровых лягушек в природе и в неволе.
Хитридиомикоз у амфибий был впервые описан Николсом, Смитом и Гардинером. Batrachochytrium dendrobatidis — единственный представитель своего семейства, поражающий позвоночных животных, остальные инфицируют беспозвоночных. Он был описан у лягушек в условиях неволи, а позже обнаружен у свободноживущих особей и на сегодняшний день уже вызвал резкое снижение численности лягушек в почти девственных природных популяциях. (Исследования показывают, что даже те участки планеты, где не ступала нога человека, подвержены воздействию загрязняющих веществ, источники которых могут находиться за тысячи километров.) Клинические признаки варьируют от внезапной гибели без видимых симптомов до прогрессирующей летаргии, интенсивной линьки, отеков живота, покраснения кожи, деформации кератиновых выступов у головастиков и кожных повреждений на кончиках пальцев у взрослых. Диагноз ставится на основании обнаружения возбудителя в кожных соскобах или образцах тканей при биопсии или методом ПЦР. Болезнь хорошо поддается терапии ваннами с итраконазолом или миконазолом (0,01% раствор имидазола в 0,6% солевом растворе по 5 минут ежедневно в течение 11 дней). В природных популяция гриб персистирует, пока не разработано эффективных средств контроля.
Другие грибковые инфекции у амфибий при правильном содержании встречаются редко. Большинство этих грибков могут поражать как водные, так и наземные виды. Воротами инфекции чаще всего является поврежденная кожа. Травмы могут возникать в результате столкновения с предметами внутреннего обустройства террариума или при агрессии со стороны соседей, например, в брачный период. Чувствительность к грибковым заболеваниям повышается при содержании в неподходящих условиях.
Сапролегниоз — болезнь, поражающая водных амфибий, которую вызывают более чем 20 видов водных грибов. Типичным признаком является наличие похожего на вату материала на коже или в ротовой полости, под которым могут обнаруживаться язвы. Цвет грибковых поражений характеризует остроту процесса — свежие окрашены в светлые тона, более старые имеют зеленоватый оттенок из-за наличия на них водорослей. На месте повреждений могут развиваться вторичные бактериальные инфекции. Головастики, больные сапролегниозом, могут отказываться от пищи из-за язв в ротовой полости. Важным фактором в развитии грибка является температура, частота заболевания снижается при 19оС. Диагноз ставится при обнаружении гиф грибка в ватообразных наложениях. Эта болезнь амфибий хорошо лечится солевыми растворами и ваннами с итраконазолом, для кожных язв применяют местно мази с миконазолом или малахитовый зеленый.
Хромомикоз — болезнь лягушек, вызываемая несколькими группами окрашенных грибов. Кожные повреждения представляют собой светло-коричневые или темно-серые выпуклые узелки, системно болезнь у лягушек проявляется истощением и потерей веса. Предварительный диагноз ставится при обнаружении возбудителя в мазках и кожных соскобов с пораженных участков, окончательный — после исследования гистологии и получения культуры грибов на питательной среде. В отличие от сапролегниоза, хромомикоз — системное заболевание, грибковые узелки формируются во внутренних органах и в коже. Течение болезни медленное, лечение неэффективно, кожные повреждения удаляют криохирургическими методами.
Плесневые грибы часто поражают икру амфибий при несоблюдении необходимых условий окружающей среды. Икра квакш, например, плесневеет при наличии слишком большого количества свободной воды, а икра саламандр — при слишком высокой температуре и недостатке кислорода в воде. Плесень может не уничтожить эмбрион, но повредить желток. Что приведет к гибели головастика в течении 72 часов после вылупления.
