Змеи (Natrix natrix и Vipera berus), птицы (Corvus corax, C. corone, Ardea cinerea, Ixobrychus minutus, Bubo bubo, Strix aluco, Aquila pomarina, Falco vespertinus, Butastur indicus, Circus aerugineus, Perms apivorus и, особенно, Buteo buteo), и некоторые млекопитающие (Cricetus cricetus, Rattus norvegicus, Talpa altaica, Meles meles, Martes zibellina, Mustela colonocus и M. putorius) поедают обыкновенную жабу. Среди земноводных Bombina variegates и зеленые лягушки (Rana lessonae и R. ridibunda) известны как враги личинок и/или сеголеток. Известен каннибализм. При встрече с потенциальным хищником, взрослая жаба приподнимается на прямых ногах и наклоняет голову в сторону опасности
У обыкновенной жабы известны многие паразиты. Monogenoidea: Polystoma integerrimum; Trematoda: Goigoderina vitelliloba, Diplodiscus subclavatus, Opisthioglyphe ranae, Pneumonoeces variegatus, Pleurogenes claviger.Pleuivgenoides medians, Prosotocus confusus, Strigea strigis, Alaria alata; Acanthocephala: Acanthocephalas ranae, A. falcatus; Nematoda: Rhabdias bufonis, Oswaldocniziafiliformis, O. iwanitzkyi, Aplectana acuminata, A. multipapilosa, Cosmocerca comaiutata, C. ornata, A. sp., Neoxysomatium brevicaudatum, Neoraillietnema praeputiale. Среди них нематоды Cosmocerca comiutata и Oswaldobttzia ivanitzkyi специфичны для рода Bufo. В кишечнике обнаружено несколько видов простейших. Отмечено паразитирование мухи Lucilia bufonivora на молодых и взрослых жабах
У В. bufo известны многочисленные аномалии: деформации осевого скелета, эктромелия, полимелия и, чаще всего, полидактилия. На Украине найдена жаба — альбинос.
Влияние антропогенных факторов
Разрушение лесов и лугов, осушение водоемов составляют наиболее серьезную опасность для серой жабы. Эти факторы привели к вымиранию некоторых популяций. Обезлесение юга европейской части СССР могло иметь результатом постепенное отступление ареала на север. Загрязнение среды минеральными удобрениями и промышленными отходами, урбанизация, рекреация, гибель на автодорогах, бессмысленное уничтожение людьми и т.д. ведет к постепенному сокращению популяций жабы в поселках и городах. Xотя некоторые популяции способны выживать даже в городах, вид имеет незначительную способность к синатропизации: жаба практически вымерла в таких крупных городах, как Москва, Нижний Новгород и др.
