Зеленая жаба населяет, пожалуй, самый широкий спектр биотопов из всех водных Палеарктики. Обитает в зонах леса, лесостепи, степи, полупустыни и пустыни. Она более устойчива к сухим условиям, чем любой другой вид земноводных СССР. Зеленая жаба населяет как переувлажненные болотистые местности, так и пустыни разных типов. В зоне лесов она обитает обычно на открытых местах и в зарослях кустарников, зачастую далеко от водоемов. В сухих южных районах встречается в основном во влажных местах: в оазисах, на берегах арыков и озер. Здесь она использует арыки и каналы как коридоры для расселения. В горах обитает в основном ниже верхней границы леса и избегает каменистых склонов и альпийских лугов.
Размножение происходит в самых разнообразных водоемах: болотах, прудах, озерах, заводях ручьев рек, водохранилищах, канавах, лужах и т.д. Как правило, эти водоемы не глубже 50 см. Икра откладывается как в пресные, так и соленые водоемы. Головастиков наблюдали даже в Аральском море там, где из дна у берега били ключи пресной воды. В северном Казахстане взрослые жабы встречаются в воде с соленостью 10,4-11,4‰. Сеголетки попадаются в заливах Каспийского моря в Дагестане.
Зеленая жаба — обычный вид на большей части своего обширного ареала. В целом, она редка у его северной границы, но местами образует плотные популяции в антропогенных ландшафтах (например, в г. Иваново ). Обитание в таких ландшафтах характерно для зеленой жабы, и в некоторых регионах ее обилие в антропогенных биотопах намного выше, чем в природных. Использование нор иногда ведет к возрастанию плотности населения в колониях некоторых грызунов. В подходящих биотопах обилие жабы достигает 2-8 (иногда до 100 и более) экз. на 100 кв.м. Плотность сеголеток в период метаморфоза достигает 70 экз./кв.м; плотность головастиков — до 750000 экз. на 450 кв.м водоема. На юго-восточном пределе распространения (юго-восток Западной Сибири) зеленая жаба наиболее многочисленна на займищах, в поселках, на сплавинах и галофитных лугах. Обилие снижается в луговых степях и сосняках, а в настоящих степях в этом регионе вид не встречен. Однако юго-западнее зеленая жаба встречается в более сухих, в том числе степных условиях. В аридных районах очевидно, распространена более неравномерно и образует плотные популяции в оазисах, изолированные от других популяций обширными, сухими и жаркими пространствами, недоступными для жаб.