Кожа амфибий покрыта роговым слоем, защищающим ее от абразивного действия грунта. Толщина этого слоя всего несколько клеток, и периодически он линяет. Некоторые амфибии едят полинявшую кожу. Кожа амфибий очень нежная, и может быть легко травмирована при неосторожном обращении или взаимодействии с неподходящим грунтом, что открывает ворота инфекции. Таким образом, даже небольшие царапины могут стать причиной серьезных проблем со здоровьем. Базальный эпителий — источник регенерации рогового слоя в толщину составляет всего 4-5 клеточных слоев и также может быть легко поврежден.
Кожные железы продуцируют разнообразные виды секрета. Слизь помогает снизить потери воды, однако не предотвращает их совсем, поэтому амфибий необходимо содержать во влажных условиях.
Кожные железы также могут выделять яд, что хорошо изучено у древолазов. Яд также может выделяться и другими железами (например, околоушными у жабы-аги). При манипуляциях с такими животными лучше одевать перчатки. Кроме яда, железы амфибий могут секретировать и другие вещества, некоторые из которых обладают удивительными свойствами, например, могут замедлять рост болезнетворных микроорганизмов.
Несмотря на то, что у некоторых амфибий имеются твердые или острые структуры, напоминающие когти (например, у обыкновенной шпорцевой лягущки Xenopus laevis), настоящий когтей и чешуй у них нет.
